More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2369 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 423 aa  844    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  75.4 
 
 		 472 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  64.41 
 
 		 480 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  58.68 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  41.71 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  42.25 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  40.53 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  41.36 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  38.7 
 
 		 385 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  38.86 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  38.7 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  39.64 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  41.08 
 
 		 378 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  39.69 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  39.78 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  39.07 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  37.28 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  39.29 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  39.36 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  38.99 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  37.17 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  36.64 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  39.39 
 
 		 393 aa  203  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  37.17 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  40.73 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  40.45 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  36.14 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 		 416 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34.03 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  34.06 
 
 		 539 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 373 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  35.42 
 
 		 512 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  33.03 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  34.76 
 
 		 592 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.42 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.77 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  33.13 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  34.77 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  33.13 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 386 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  34.21 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  32.13 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  26.87 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 		 408 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  21.8 
 
 		 389 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.85 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.67 
 
 		 409 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.46 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  39.04 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  24.93 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>