More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1693 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
377 aa  765    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  99.47 
 
 
377 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  58.47 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  58.47 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  59.65 
 
 
368 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  55.41 
 
 
370 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  55.19 
 
 
367 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  55.83 
 
 
374 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  55.56 
 
 
374 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  56.98 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  56.7 
 
 
371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  57.1 
 
 
373 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  45.26 
 
 
379 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  45.33 
 
 
378 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  41.82 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  41.31 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  40.87 
 
 
382 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  35.47 
 
 
398 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
385 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
385 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  35.9 
 
 
385 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  34.87 
 
 
392 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 
377 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 
395 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  36.52 
 
 
385 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
374 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 
380 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 
375 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
382 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
382 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  32.29 
 
 
386 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.06 
 
 
388 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 
382 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  33.99 
 
 
408 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
388 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
388 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  34.23 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 
411 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
386 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
394 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
403 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
382 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
472 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
363 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
408 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 
384 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
385 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
386 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
385 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
383 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 
383 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  33.92 
 
 
393 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
391 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.77 
 
 
480 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.28 
 
 
517 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
383 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
382 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  28.96 
 
 
497 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
592 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
426 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
416 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.76 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  26.03 
 
 
539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.44 
 
 
370 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  27.65 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
386 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.11 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.77 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.65 
 
 
512 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  27.32 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.42 
 
 
519 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.73 
 
 
380 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
409 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.63 
 
 
409 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
406 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  27.45 
 
 
380 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25.86 
 
 
410 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  32.49 
 
 
407 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>