More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2334 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  99.74 
 
 		 388 aa  776    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 388 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  31.38 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  31.59 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  32.92 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  31.79 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  32.57 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  32.42 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  29.4 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  30.49 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  31.29 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.42 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  27.97 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.11 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  28.79 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.18 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.74 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  22.86 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  27.63 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  32.54 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 592 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 519 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.59 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.22 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.16 
 
 		 512 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  26.54 
 
 		 539 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.3 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.8 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>