More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3749 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 374 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  99.47 
 
 		 374 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  62.97 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  61.35 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  61.43 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  61.62 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  63.64 
 
 		 373 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  62.12 
 
 		 368 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  60.63 
 
 		 368 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  55.56 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  55.56 
 
 		 377 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  55.71 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  44.59 
 
 		 378 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  47.84 
 
 		 379 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  39.46 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  41.38 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  40.98 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  34.04 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.42 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  35.23 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  35.49 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  35.59 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  34.3 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  33.87 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  33.69 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.06 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  34.28 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  32.47 
 
 		 480 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  30.58 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  32.59 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  31.56 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  27.97 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.04 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  27.86 
 
 		 497 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.77 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  30.58 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.82 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.41 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.12 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.65 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 386 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  26.44 
 
 		 539 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.45 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  25.21 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 436 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  30.8 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  25.4 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  25.27 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>