207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0707 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 382 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  35.14 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  37.06 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 398 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  37.29 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.61 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  32.48 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  31.61 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  37.08 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  37.08 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  29.37 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  30.2 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.19 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.79 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.85 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.43 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.89 
 
 		 496 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.88 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 519 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 592 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.21 
 
 		 517 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.45 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  28.48 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.23 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  27.94 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  26.88 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  28.57 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  22.33 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  30.15 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  21.33 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.08 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>