191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2660 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 379 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 374 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  29.58 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  27.72 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.37 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.76 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  27.89 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  27.86 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.54 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  26.61 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  24.79 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.72 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  23.25 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  23.05 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.37 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  26.06 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.73 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.47 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 592 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  25.89 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  22.65 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  23.43 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.47 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.75 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 517 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  22.93 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>