259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1020 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 383 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  30.23 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  31.83 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  34.42 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  29.28 
 
 		 386 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  31.65 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  29.9 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  31.95 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.91 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 480 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.27 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.63 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.48 
 
 		 519 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.86 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.12 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  26.87 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  25.69 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  20.54 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.23 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.86 
 
 		 496 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 517 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  23.72 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  22.79 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  24.43 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  24.8 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  33.55 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  21.3 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5144  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>