201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5144 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5144  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  37.1 
 
 		 378 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  35.1 
 
 		 380 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 377 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.54 
 
 		 385 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 385 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  33.68 
 
 		 379 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.72 
 
 		 386 aa  92  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 		 382 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 386 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 		 382 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 		 378 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 374 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  38.16 
 
 		 373 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 368 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 		 384 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  37.13 
 
 		 374 aa  85.1  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  36.53 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  37.78 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 398 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  32.42 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  34.46 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.85 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  36.77 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  36.77 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  31.3 
 
 		 383 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  34.59 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 592 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 377 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  34.75 
 
 		 383 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  32.52 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.51 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 408 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 376 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.7 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  27.78 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  22.86 
 
 		 394 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 379 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 381 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 386 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 		 416 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 375 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 		 416 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 		 382 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 		 375 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 412 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 386 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 399 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 381 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 		 413 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 519 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>