More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3577 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 412 aa  833    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  64.78 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  65.05 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  62.47 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  59.36 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  59.09 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  44.16 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  44.1 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.85 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  42.78 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  44.29 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  43.78 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  42.39 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  43.51 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  41.58 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  40.38 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  39.52 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  38.34 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  35.28 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.65 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 373 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.12 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 376 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  34.81 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  34.44 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.26 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.69 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  32.78 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.36 
 
 		 393 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.96 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.96 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  32.53 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.36 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 379 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 381 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 383 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.46 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.345866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>