More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1822 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
381 aa  768    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  57.22 
 
 
382 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  59.94 
 
 
381 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.26 
 
 
388 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 
388 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  48.75 
 
 
379 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  49.03 
 
 
382 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.17 
 
 
473 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.17 
 
 
473 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.17 
 
 
385 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.91 
 
 
473 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.17 
 
 
385 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  48.91 
 
 
382 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.91 
 
 
473 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.91 
 
 
473 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  48.9 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  48.9 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  48.9 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  47.5 
 
 
383 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  47.59 
 
 
386 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  47.86 
 
 
385 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.35 
 
 
385 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.93 
 
 
385 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  48.61 
 
 
381 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 
382 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  45.96 
 
 
382 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  47.37 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  48.08 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  48.31 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  48.32 
 
 
382 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 
385 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 
383 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  48.06 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.75 
 
 
386 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  45.72 
 
 
385 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  48.33 
 
 
382 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  46.13 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 
385 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  47.06 
 
 
385 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  43.54 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  45.45 
 
 
411 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.85 
 
 
389 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  45.99 
 
 
379 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  43.77 
 
 
383 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45 
 
 
410 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  43.49 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  45.48 
 
 
397 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  44.75 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.02 
 
 
389 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.02 
 
 
389 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  45.3 
 
 
377 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.87 
 
 
381 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.9 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.34 
 
 
389 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  42.06 
 
 
389 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.53 
 
 
382 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  40.16 
 
 
379 aa  295  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  42.2 
 
 
397 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  43.09 
 
 
381 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  41.05 
 
 
377 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  42.13 
 
 
397 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  42.06 
 
 
377 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 
377 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  38.9 
 
 
380 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  39.11 
 
 
387 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  38.83 
 
 
387 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  38.01 
 
 
385 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  40.68 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  41.27 
 
 
379 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  39.51 
 
 
385 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  41.14 
 
 
381 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
385 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.51 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0817  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.51 
 
 
385 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.55 
 
 
391 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.55 
 
 
394 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.55 
 
 
394 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  39.55 
 
 
385 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 
381 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  36.26 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  35.68 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  35.01 
 
 
387 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3250  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  35.4 
 
 
378 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.281786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 
384 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  33.98 
 
 
388 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 
394 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 
394 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.71 
 
 
378 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 
379 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
379 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
379 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 
381 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.17 
 
 
380 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
380 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
389 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>