More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0376 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 381 aa  762    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  71.58 
 
 		 381 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  61.3 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  60.73 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  61.97 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  59.06 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  47.12 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.34 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  46.72 
 
 		 379 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  45.93 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  45.45 
 
 		 380 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  46.52 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  46.46 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  47.61 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  46.63 
 
 		 380 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  43.24 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  42.36 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  42.45 
 
 		 383 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  41.28 
 
 		 393 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  42.15 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  39.04 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  41.23 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  40.43 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  39.84 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  37.2 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  37.17 
 
 		 397 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  38.2 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  35.83 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35.46 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 		 382 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.48 
 
 		 382 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  36.07 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.61 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  35.52 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  37.24 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  35.42 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  33.77 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  33.94 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.7 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.77 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  32.73 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.64 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  33.98 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  35.66 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.66 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.66 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 		 386 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.49 
 
 		 473 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.66 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.49 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.73 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.73 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.7 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.75 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.75 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.19 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.77 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.2 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>