More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3951 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
385 aa  785    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  80.56 
 
 
382 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  76.47 
 
 
383 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  75 
 
 
385 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  72.55 
 
 
379 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  71.07 
 
 
382 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  69.6 
 
 
382 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  67.29 
 
 
379 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  69.83 
 
 
383 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  70 
 
 
382 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  68.32 
 
 
388 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  69.25 
 
 
382 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  69.25 
 
 
382 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.69 
 
 
388 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  63.28 
 
 
386 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  62.5 
 
 
386 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.76 
 
 
386 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  69.38 
 
 
382 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  62.44 
 
 
385 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  61.92 
 
 
385 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  62.69 
 
 
385 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.92 
 
 
385 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  62.69 
 
 
385 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  62.69 
 
 
385 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.47 
 
 
385 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  64.8 
 
 
385 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  64.71 
 
 
381 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
473 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
473 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
385 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
473 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
385 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
473 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  63.21 
 
 
473 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  64.66 
 
 
410 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  63.49 
 
 
411 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  64.89 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  60.96 
 
 
397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  58.71 
 
 
382 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  54.55 
 
 
389 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  57.38 
 
 
389 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  57.1 
 
 
389 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  54.66 
 
 
390 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  59.55 
 
 
387 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  58.99 
 
 
387 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  54.6 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  55.43 
 
 
379 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  53.93 
 
 
397 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  52.12 
 
 
389 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.51 
 
 
389 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  48.01 
 
 
383 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  55.87 
 
 
397 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.4 
 
 
395 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  48.54 
 
 
383 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  51.82 
 
 
377 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  50.7 
 
 
377 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  52.94 
 
 
381 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.32 
 
 
381 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  51.37 
 
 
385 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.37 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  45.57 
 
 
377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  51.68 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0817  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.82 
 
 
385 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  50.55 
 
 
377 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  45.41 
 
 
381 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  46.84 
 
 
380 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.84 
 
 
391 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.84 
 
 
394 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.84 
 
 
394 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  47.72 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.18 
 
 
382 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  46.01 
 
 
381 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  45.53 
 
 
377 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  43.2 
 
 
385 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  45.14 
 
 
387 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  45.6 
 
 
388 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  46.28 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  44.03 
 
 
385 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 
384 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  44.71 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  44.35 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  42.41 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  43.27 
 
 
381 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  41.8 
 
 
384 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3250  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  42.03 
 
 
378 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.281786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  36.99 
 
 
392 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  37.73 
 
 
379 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.54 
 
 
378 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  34.55 
 
 
379 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  35.36 
 
 
379 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.87 
 
 
380 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
394 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  35.25 
 
 
382 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
381 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  33.98 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  34.53 
 
 
379 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>