More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0668 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 392 aa  796    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  60.2 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  56.88 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  48.11 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  46.52 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  45.23 
 
 		 383 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  44.94 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  44.19 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  43.68 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.1 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  45.35 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  41.18 
 
 		 385 aa  315  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  42.63 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  41.84 
 
 		 379 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  41.81 
 
 		 379 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  42.25 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.18 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  42.3 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  42.15 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  42.22 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  41.94 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  39.89 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  37.92 
 
 		 396 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 396 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  38.42 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  40.93 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  39.22 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  39.61 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  40.33 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  39.94 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.56 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.78 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.94 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  37.54 
 
 		 383 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  39.39 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  38.44 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.49 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.11 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.29 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  39 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  37.3 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  39.44 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  37.98 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  38.36 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.72 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  36.74 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  37.07 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.88 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  35.08 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.61 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.33 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  32.04 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.52 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.89 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.92 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.4 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  30.62 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.08 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>