More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0524 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
382 aa  774    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  58.42 
 
 
379 aa  471  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  60.28 
 
 
381 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  57.41 
 
 
383 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  57.69 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.95 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  55.71 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  57.58 
 
 
382 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  56.79 
 
 
381 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  56.25 
 
 
385 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.98 
 
 
385 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  55.71 
 
 
385 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  56.25 
 
 
385 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  55.71 
 
 
385 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  56.25 
 
 
385 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  54.38 
 
 
386 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  57.22 
 
 
379 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  54.81 
 
 
385 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  58.94 
 
 
385 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  58.06 
 
 
382 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  56.02 
 
 
385 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  54.67 
 
 
382 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  56.39 
 
 
383 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.53 
 
 
385 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  55.43 
 
 
386 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.99 
 
 
386 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  55.83 
 
 
382 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
473 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
385 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
473 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
473 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
473 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
473 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  55.1 
 
 
381 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.99 
 
 
385 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  56.23 
 
 
382 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  57.26 
 
 
385 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  55.56 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  53.09 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  52.38 
 
 
389 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  50.98 
 
 
389 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.63 
 
 
410 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  52.63 
 
 
411 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  52.02 
 
 
390 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  52.1 
 
 
389 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  48.55 
 
 
379 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
397 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  47.85 
 
 
383 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  47.04 
 
 
383 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.3 
 
 
389 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.86 
 
 
395 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  49.03 
 
 
389 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  48.6 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  46.83 
 
 
380 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
385 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  45.97 
 
 
377 aa  342  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  47.88 
 
 
381 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 
385 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.24 
 
 
381 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  47.04 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  46.89 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0817  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.46 
 
 
385 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
385 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  45.48 
 
 
377 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  45.6 
 
 
379 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.59 
 
 
382 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.58 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.58 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.58 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  45.17 
 
 
377 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  45.17 
 
 
377 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  44.23 
 
 
377 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  42.11 
 
 
385 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  42.69 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  42.93 
 
 
381 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 
385 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  41.48 
 
 
379 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  40.26 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  41.32 
 
 
381 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  39.94 
 
 
388 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  39.12 
 
 
387 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  39.39 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  38.4 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3250  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  36.94 
 
 
378 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.281786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  36.81 
 
 
392 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 
379 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 
394 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 
385 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 
382 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 
379 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.51 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
394 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 
379 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 
379 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  32.3 
 
 
393 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 
379 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
389 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
379 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>