More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3105 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
389 aa  790    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  47.64 
 
 
392 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  44.42 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  43.34 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  43.58 
 
 
379 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  43.42 
 
 
380 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  40.58 
 
 
380 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.21 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  38.05 
 
 
385 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  40.62 
 
 
379 aa  301  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  40.61 
 
 
393 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  40.89 
 
 
379 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  39.12 
 
 
383 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 
379 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 
382 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  41.06 
 
 
399 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 
393 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.27 
 
 
378 aa  288  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  40.5 
 
 
379 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  39.58 
 
 
381 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 
396 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  37.11 
 
 
383 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  40.43 
 
 
379 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  37.69 
 
 
381 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
381 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  36.27 
 
 
405 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  36.53 
 
 
396 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 
381 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  37.34 
 
 
385 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.83 
 
 
385 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  37.34 
 
 
385 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  37.34 
 
 
385 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  36.83 
 
 
385 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  37.53 
 
 
385 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  37.17 
 
 
386 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 
385 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  38.19 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.19 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.04 
 
 
385 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
473 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35.93 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
473 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
385 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
473 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.58 
 
 
385 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.46 
 
 
382 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 
386 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 
383 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.16 
 
 
386 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
382 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  34.82 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  35.17 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  34.21 
 
 
383 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  34.89 
 
 
411 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.62 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  34.79 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 
382 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
379 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 
385 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  31.7 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.15 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  32.21 
 
 
390 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
382 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
385 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.61 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.06 
 
 
389 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.25 
 
 
382 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
381 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
379 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
383 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
377 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 
381 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.8 
 
 
384 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  29.35 
 
 
389 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.08 
 
 
389 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
379 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.8 
 
 
395 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
386 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
377 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
386 aa  156  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
382 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.8 
 
 
391 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.8 
 
 
394 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.8 
 
 
394 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
385 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>