More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3823 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 394 aa  805    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  60.2 
 
 		 392 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  57.22 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.52 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  45.25 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  44.85 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  45.22 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  41.77 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  41.9 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  43.91 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  44.85 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  43.65 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  43.1 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  44.13 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  40.95 
 
 		 382 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.13 
 
 		 378 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  40.68 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  42.78 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  41.67 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  38.66 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  39.44 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  36.59 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  38.92 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  38.12 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  38.74 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  36.69 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.33 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  36.84 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  34.89 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.78 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  34.81 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  36.32 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  34.24 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  34.53 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.7 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  35.08 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.25 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 473 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 473 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 473 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.53 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.61 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.2 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.2 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.98 
 
 		 382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.65 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.11 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.63 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.84 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  26.43 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>