More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2494 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
379 aa  763    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  55.41 
 
 
379 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  55.29 
 
 
383 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  54.81 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.55 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  58.22 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  55.59 
 
 
379 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  52.76 
 
 
382 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  53.65 
 
 
385 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  55.46 
 
 
382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  52.93 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  52.09 
 
 
381 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  51.97 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  51.7 
 
 
386 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  52.65 
 
 
382 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  51.1 
 
 
383 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  52.22 
 
 
382 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  51.43 
 
 
385 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  51.49 
 
 
386 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  51.17 
 
 
385 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  51.86 
 
 
377 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  51.43 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  51.43 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  55.43 
 
 
385 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  51.43 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  52.5 
 
 
385 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.39 
 
 
385 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.43 
 
 
385 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  53.89 
 
 
385 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
380 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  52.39 
 
 
377 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  53.4 
 
 
381 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  51.39 
 
 
382 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  51.83 
 
 
377 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.37 
 
 
386 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
382 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.61 
 
 
385 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.74 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.74 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.74 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.74 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.61 
 
 
385 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.74 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  46.74 
 
 
389 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  47.95 
 
 
385 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  46.58 
 
 
390 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  48.68 
 
 
377 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  47.49 
 
 
411 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
379 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  47.9 
 
 
389 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.78 
 
 
389 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.22 
 
 
389 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 
385 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  48.4 
 
 
385 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  47.21 
 
 
379 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.91 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  45.6 
 
 
387 aa  338  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 
397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  48.19 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.71 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  45.71 
 
 
389 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  48.32 
 
 
387 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.71 
 
 
395 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  47.08 
 
 
384 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  48.32 
 
 
387 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  47.65 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  44.8 
 
 
383 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  44.53 
 
 
383 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  46.93 
 
 
381 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.15 
 
 
382 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  45.99 
 
 
381 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  43.6 
 
 
388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  45.41 
 
 
397 aa  316  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  46.11 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.31 
 
 
381 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  45.23 
 
 
385 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  42.19 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.41 
 
 
385 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  45.15 
 
 
385 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0817  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.41 
 
 
385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.32 
 
 
391 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.32 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.32 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3250  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  42.9 
 
 
378 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.281786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  44.66 
 
 
381 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 
392 aa  216  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 
385 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
394 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  34.45 
 
 
379 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  34.63 
 
 
379 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
379 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.98 
 
 
378 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
394 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  35.66 
 
 
381 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  35.89 
 
 
396 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
380 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.54 
 
 
380 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>