More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4127 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 400 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  40.62 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.81 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.2 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  28.67 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 379 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.72 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 394 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 		 398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 381 aa  116  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.74 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 382 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.86 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.71 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  28.47 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  31.66 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  27.17 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.87 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.87 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.16 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.48 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.52 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>