More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2956 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 400 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  58 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  59.32 
 
 		 380 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  59.21 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  44.64 
 
 		 391 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  38.2 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  37.92 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  38.01 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  38.95 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  36.41 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  38.18 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  41.19 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  35.35 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  37.18 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  35.75 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  35.67 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  32.5 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  32.67 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 		 381 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 384 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.94 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  30.14 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 399 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.27 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  30.45 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  35.77 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.48 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.44 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.83 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.83 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 383 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.97 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>