More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  63.33 
 
 
389 aa  474  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  52.45 
 
 
403 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  54.52 
 
 
401 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  41.33 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  43.98 
 
 
412 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  44.26 
 
 
406 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  36.6 
 
 
396 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  35.84 
 
 
391 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 
400 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
403 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  34.52 
 
 
413 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
386 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
383 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
401 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
383 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
401 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
392 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
401 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
380 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  32.45 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
400 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  34.28 
 
 
384 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 
381 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
381 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.35 
 
 
402 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.5 
 
 
399 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 
381 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
399 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
399 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  32.85 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
395 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
396 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  31.29 
 
 
384 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
397 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.9 
 
 
376 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 
814 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  30.9 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 
380 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
386 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
380 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
386 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
371 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.03 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
391 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
391 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.62 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.12 
 
 
382 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  31.84 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
382 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.97 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 
384 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 
384 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
376 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  31.84 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2492  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.977518  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  28.65 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 
381 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  33.13 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
460 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>