More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3774 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
381 aa  762    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  46.68 
 
 
380 aa  329  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  49.71 
 
 
391 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 
383 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  44.5 
 
 
382 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  43.47 
 
 
413 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
403 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
403 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
403 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  40.18 
 
 
425 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
403 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  37.88 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  36.73 
 
 
396 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  38.51 
 
 
380 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  36.95 
 
 
412 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 
403 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 
393 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  34.52 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
419 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  32.65 
 
 
393 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.78 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  35.35 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  34.82 
 
 
374 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
390 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 
460 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
381 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
386 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
381 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.79 
 
 
369 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03307  leucine transporter subunit  35.42 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  33.33 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03260  hypothetical protein  35.42 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 
379 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 
371 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  35.85 
 
 
373 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 
371 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
379 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 
371 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.87 
 
 
379 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 
389 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.23 
 
 
402 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  36.59 
 
 
371 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
384 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  34.04 
 
 
369 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  34.04 
 
 
369 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  34.04 
 
 
369 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  34.04 
 
 
369 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.18 
 
 
371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  34.04 
 
 
369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
371 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 
399 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 
371 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 
384 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
370 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.49 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
401 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 
400 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  30.82 
 
 
373 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  36.95 
 
 
370 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
382 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  34.89 
 
 
371 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 
382 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
371 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  29.9 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.43 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.71 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
814 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
380 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 
370 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  31.71 
 
 
380 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  36.55 
 
 
370 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  34.54 
 
 
369 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
380 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  30.87 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  30.87 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  30.87 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
381 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
380 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  30.74 
 
 
384 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 
380 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>