More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2877 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 419 aa  848    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  43.26 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  41.61 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  40.69 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  41.44 
 
 		 425 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 398 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 814 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 392 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 392 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.16 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.9 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.06 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.98 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 372 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 372 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.76 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.75 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.16 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 372 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 382 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.87 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  25.36 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.86 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>