More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3060 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 425 aa  849    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  64.4 
 
 		 413 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  62.57 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  62.57 
 
 		 403 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  56.88 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  62.57 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  62.57 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  40.68 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  40.96 
 
 		 382 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  40.54 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  42.04 
 
 		 380 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  39.88 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  39.06 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 		 392 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  36.15 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  34.9 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.72 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 376 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 599 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.57 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  30.5 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1109  Extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 380 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  29.44 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 381 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.55 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.4 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  28.83 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.09 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 		 460 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.91 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.26 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  28.83 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.99 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.32 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  30.99 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.78 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>