More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1109 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1109  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 387 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  50.43 
 
 		 388 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  50.72 
 
 		 388 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.86 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  47.2 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  47.2 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  46.93 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  46.28 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.43 
 
 		 408 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  45.98 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  44.83 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  43.04 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  46.28 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  44.26 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  42.18 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  43.1 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  42.78 
 
 		 378 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  42.78 
 
 		 378 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  42.19 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  42.5 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  42.22 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  42.22 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  42.22 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  42.53 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.58 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.89 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  39.63 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  40.85 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  42.43 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  42.17 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.67 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  42.43 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  39.1 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.16 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  39.58 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  40.58 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  40.43 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.59 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  42.32 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  42.21 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  38.2 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.48 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.2 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.19 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.19 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.19 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.19 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  41.19 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.43 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  40.91 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  41.19 
 
 		 662 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.06 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  40.87 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  41.76 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  41.74 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  38.92 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  42.05 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  40.73 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  39.61 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  41.48 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3474  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4047  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  41.19 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 		 382 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  41.19 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 		 392 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  42.57 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  41.21 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  37.95 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.86 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  42.15 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  39.31 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  37.95 
 
 		 461 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  37.95 
 
 		 461 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  38 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  38.57 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.95 
 
 		 515 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  40.46 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.46 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  38.68 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.46 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  40.46 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.46 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.46 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  40.75 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  38.68 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>