More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3574 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
403 aa  813    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  87.1 
 
 
403 aa  709    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  95.78 
 
 
403 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  87.1 
 
 
403 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  87.1 
 
 
403 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  60.53 
 
 
413 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  62.57 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 
391 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  40.4 
 
 
380 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  39.58 
 
 
382 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
381 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  38.42 
 
 
383 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  37.92 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 
396 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  35.91 
 
 
380 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  35.01 
 
 
392 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
412 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  36.05 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 
401 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
390 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 
403 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
422 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 
381 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
392 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
392 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
392 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
381 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.41 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.99 
 
 
428 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
814 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  30.72 
 
 
377 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  33.55 
 
 
395 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
386 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
378 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
379 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
379 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
379 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
379 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
397 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
379 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
401 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  30.28 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.23 
 
 
379 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.91 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
388 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
382 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
371 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
401 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
388 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.06 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.06 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.06 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.06 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.06 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  30.06 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.75 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.49 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.06 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  30.54 
 
 
376 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  30.54 
 
 
376 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  30.54 
 
 
599 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.81 
 
 
373 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.77 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
383 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  28.78 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.78 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>