More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0104 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  91.56 
 
 		 379 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  91.56 
 
 		 379 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  91.2 
 
 		 375 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  91.56 
 
 		 379 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  99.47 
 
 		 379 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  91.29 
 
 		 379 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  95.25 
 
 		 379 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  91.82 
 
 		 379 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  97.1 
 
 		 379 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.94 
 
 		 382 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  82.72 
 
 		 382 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  97.1 
 
 		 379 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  97.36 
 
 		 379 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 379 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  91.29 
 
 		 379 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  81.68 
 
 		 382 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  91.29 
 
 		 379 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  97.1 
 
 		 379 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  68.93 
 
 		 383 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  69.45 
 
 		 383 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  71.12 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  69.81 
 
 		 381 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  71.95 
 
 		 381 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  67.79 
 
 		 380 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  58.51 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  58.51 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  58.78 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  58.51 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  58.51 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  58.78 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.24 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  53.97 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  53.41 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  50.69 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.74 
 
 		 383 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  47.73 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.08 
 
 		 515 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  49.72 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  49.21 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  48.03 
 
 		 382 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  47.97 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  49.31 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  48.11 
 
 		 380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  48.75 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.75 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  51.18 
 
 		 400 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.42 
 
 		 467 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  46.54 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.71 
 
 		 376 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.43 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.71 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  48.16 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  48.03 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  48.86 
 
 		 399 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.86 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.86 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.86 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  50.86 
 
 		 372 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  46.05 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  50.86 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.86 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  49.15 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 		 383 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.44 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  48.57 
 
 		 380 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  50.74 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.29 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  47.37 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.17 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.17 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.17 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  49.17 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.17 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  49.17 
 
 		 662 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.29 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  45.8 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  50.45 
 
 		 401 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  48.9 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  45.8 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.85 
 
 		 377 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.89 
 
 		 383 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  48 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3474  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4047  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>