More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0341 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 389 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  63.33 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  64.08 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  63.66 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  47.07 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  51.12 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  40.41 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  39.6 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  36.78 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  35.57 
 
 		 425 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  34.52 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  35.8 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  34.38 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 401 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.81 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.9 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  34.36 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 460 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 376 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.52 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.8 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.52 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.96 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  32.21 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  33.98 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  33.63 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  33.02 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  33.02 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  33.02 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  33.84 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.43 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2492  Extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.977518  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 814 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  29.92 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  31.98 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  32.48 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  31.17 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  32.86 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>