More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1469 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
396 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  58 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  65.53 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  58.19 
 
 
380 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  42.73 
 
 
391 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  35.01 
 
 
403 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  33.09 
 
 
403 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  38.6 
 
 
382 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  39.17 
 
 
425 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  39.88 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  40.57 
 
 
389 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
403 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
403 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
403 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  37.79 
 
 
403 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  36.99 
 
 
381 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 
412 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 
380 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  35.91 
 
 
393 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  36.32 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  37.71 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  36.6 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  33.52 
 
 
413 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  34.94 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 
393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 
399 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 
401 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 
401 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 
401 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  36.75 
 
 
376 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  36.44 
 
 
384 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.58 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 
382 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  33.99 
 
 
383 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
384 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
381 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
382 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.13 
 
 
380 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
400 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  34.65 
 
 
381 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  33.62 
 
 
377 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
383 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  32.57 
 
 
382 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.05 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
382 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
392 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
392 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
382 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
391 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
391 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  34.1 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.56 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.29 
 
 
396 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  34.19 
 
 
383 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.86 
 
 
515 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.29 
 
 
380 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.29 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.95 
 
 
428 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
380 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  34.55 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.95 
 
 
467 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  32.85 
 
 
381 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
396 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
398 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
378 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 
373 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
814 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 
381 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
382 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
382 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.71 
 
 
382 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 
376 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
382 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  31.71 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
380 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  31.71 
 
 
382 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 
401 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>