More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2938 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  93.46 
 
 
383 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
383 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  75.21 
 
 
467 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  69.9 
 
 
382 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  74.37 
 
 
662 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.72 
 
 
382 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  74.72 
 
 
382 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.72 
 
 
382 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.72 
 
 
382 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  74.09 
 
 
382 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  74.72 
 
 
382 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  69.37 
 
 
515 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  69.63 
 
 
461 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  69.63 
 
 
461 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  69.63 
 
 
382 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  69.37 
 
 
382 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  69.11 
 
 
382 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  66.49 
 
 
382 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  59.69 
 
 
383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  59.95 
 
 
383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  59.32 
 
 
383 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  63.51 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  59.77 
 
 
392 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  59.42 
 
 
383 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3474  extracellular ligand-binding receptor  59.42 
 
 
383 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4047  extracellular ligand-binding receptor  59.42 
 
 
383 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  58.29 
 
 
382 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  51.24 
 
 
371 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  51.06 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  51.32 
 
 
379 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  51.06 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.06 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  51.63 
 
 
375 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 
379 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 
379 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  53.45 
 
 
386 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  50.26 
 
 
379 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  52.74 
 
 
382 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.47 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.16 
 
 
382 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  49.6 
 
 
377 aa  352  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  48.95 
 
 
383 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  51 
 
 
383 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  48.86 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  49.14 
 
 
381 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  49.14 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  49.48 
 
 
383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  49.21 
 
 
383 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.88 
 
 
428 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  48.61 
 
 
388 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  48.22 
 
 
388 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  47.78 
 
 
382 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  49.43 
 
 
388 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  46.59 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
378 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
392 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
392 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  48.33 
 
 
388 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.63 
 
 
388 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  47.96 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  47.96 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  48.74 
 
 
401 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 
383 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  49.21 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  49.14 
 
 
398 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.82 
 
 
408 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  46.55 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  45.75 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  45.48 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.07 
 
 
402 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  47.38 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  46.9 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  46.09 
 
 
386 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  46.09 
 
 
386 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  44.26 
 
 
376 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.8 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  47.09 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  44.18 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.51 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  47.09 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.51 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.51 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  47.09 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  46.92 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.51 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  47.09 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  46.51 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.51 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.51 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  46.61 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>