More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1165 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  87.78 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  87.78 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  75.49 
 
 		 662 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  94.37 
 
 		 515 aa  878    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  87.78 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  95.03 
 
 		 382 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  75.11 
 
 		 467 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  87.78 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  87.78 
 
 		 382 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  93.46 
 
 		 382 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  87.5 
 
 		 382 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 461 aa  932    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 382 aa  767    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  94.5 
 
 		 382 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 461 aa  932    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  70.94 
 
 		 383 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  69.63 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  67.28 
 
 		 382 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  59.58 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  59.47 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  58.95 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  59.77 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  59.84 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3474  extracellular ligand-binding receptor  60.1 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4047  extracellular ligand-binding receptor  60.1 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  57.76 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  55.14 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  51.83 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  50.79 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 379 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.61 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  49.34 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  49.34 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  51.05 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  49.34 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  48.56 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  48.95 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  50.55 
 
 		 371 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  49.08 
 
 		 379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.08 
 
 		 379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  49.08 
 
 		 379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 		 379 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  53.24 
 
 		 383 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.13 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  48.95 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.77 
 
 		 379 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 379 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 379 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  48.29 
 
 		 379 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.07 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  51.05 
 
 		 383 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.41 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  47.15 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  47.52 
 
 		 378 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  46.89 
 
 		 392 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  46.89 
 
 		 392 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  47.52 
 
 		 378 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  47.52 
 
 		 378 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  46.19 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  46.19 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  46.17 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  46.83 
 
 		 377 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  47.9 
 
 		 380 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  47.91 
 
 		 388 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  47.35 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  46.74 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  47.35 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  46.74 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  47.19 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.91 
 
 		 388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  47.04 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  46.35 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  43.16 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  44.41 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  44 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  40.2 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  42.9 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.8 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  43.15 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  41.32 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.63 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  44.15 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  44.15 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  47.03 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  43.48 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  42.12 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  43.06 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.7 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.4 
 
 		 376 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  44.03 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.4 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>