More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1082 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 393 aa  790    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  45.5 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  48.32 
 
 		 412 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  48.32 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  42.24 
 
 		 390 aa  309  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  46.65 
 
 		 406 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  43.58 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  36 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  36.26 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  35.58 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  34.4 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  34.38 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.77 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 		 814 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.77 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.77 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.29 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2492  Extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.977518  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  31.92 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  31.92 
 
 		 380 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  30.75 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.07 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.41 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.36 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>