More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5539 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 392 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  63.85 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  57.83 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  58.31 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  40.47 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  36.6 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  38.07 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  36.95 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  35.75 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  35.24 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  36.6 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  36.13 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  36.31 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  36.96 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  35.36 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  34.87 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.34 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 460 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 599 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.99 
 
 		 467 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.5 
 
 		 515 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  30.68 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  32.48 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.4 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  32.5 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.4 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.58 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  32.83 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.69 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.41 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.3 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.3 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  32.41 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  32.4 
 
 		 662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.22 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.2 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>