More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2441 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  94.35 
 
 		 401 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  100 
 
 		 336 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  94.05 
 
 		 401 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  91.67 
 
 		 401 aa  620  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  90.48 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  80.65 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  80.95 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  77.38 
 
 		 399 aa  544  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  78.27 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  76.19 
 
 		 381 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  76.19 
 
 		 381 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  76.19 
 
 		 402 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  74.7 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.11 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.11 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  74.7 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  74.11 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  74.11 
 
 		 380 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.81 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  73.81 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.81 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  73.81 
 
 		 380 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.81 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 		 380 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  68.66 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  70.83 
 
 		 378 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.13 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.13 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.13 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  71.13 
 
 		 372 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  71.13 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.13 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  72.32 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  70.24 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  71.43 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  72.32 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  70.24 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  70.24 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  69.94 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  66.27 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  66.96 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.26 
 
 		 377 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  66.67 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  65.18 
 
 		 381 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  65.97 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  65.77 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  67.07 
 
 		 380 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  64.18 
 
 		 384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  62.31 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  61.16 
 
 		 460 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  57.36 
 
 		 371 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  56.05 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  55.81 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  56.4 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  55.69 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  54.49 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  54.49 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  53.15 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  52.55 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  55.99 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  54.19 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  51.34 
 
 		 383 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  51.94 
 
 		 381 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  52.4 
 
 		 376 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  54.14 
 
 		 380 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  52.1 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  51.94 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  52.13 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  49.55 
 
 		 386 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  51.94 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 		 381 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  52.4 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  52.69 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  51.64 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  52.02 
 
 		 380 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.1 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  52.1 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  52.1 
 
 		 382 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  52.96 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  52.96 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  52.96 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.65 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  52.65 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  52.65 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  52.65 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  52.65 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.02 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  51.09 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  51.71 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  50.78 
 
 		 379 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.92 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  50.16 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>