More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1023 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 373 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  94.64 
 
 		 373 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  82.04 
 
 		 373 aa  620  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.31 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  82.04 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  82.04 
 
 		 373 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  82.04 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  82.53 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  81.94 
 
 		 373 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  59.5 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  56.03 
 
 		 378 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  52.35 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5221  Extracellular ligand-binding receptor  55.04 
 
 		 379 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.029602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  49.45 
 
 		 381 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.45 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  48.91 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  51.35 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  49.71 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  51.34 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  50.73 
 
 		 400 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  48.39 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  50.58 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  50.58 
 
 		 401 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  50.57 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  47.85 
 
 		 371 aa  342  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  51.73 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  47.83 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  49.56 
 
 		 399 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  48.84 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  46.49 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  49.73 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.27 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.56 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  49.56 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.56 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  50.15 
 
 		 380 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  48.49 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.56 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  47.28 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.58 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  49.85 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  50.29 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.27 
 
 		 376 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.27 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.27 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.27 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  49.27 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  48.85 
 
 		 401 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.1 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.29 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  49.29 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.29 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  49.71 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.29 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.29 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  49.29 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.63 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  48.59 
 
 		 375 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  46.65 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  48.92 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  46.37 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  48.57 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  47.08 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  49.57 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  47.41 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  46.58 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  48.1 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  48.1 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.1 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  47.7 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  48.69 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  47.52 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.16 
 
 		 404 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  44.77 
 
 		 381 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  46.2 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  47.34 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  46.2 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  47.55 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  44.02 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.17 
 
 		 382 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  46.49 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  44.96 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  42.71 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  45.06 
 
 		 386 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  43.87 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.22 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  46.26 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  44.57 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.8 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.8 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  44.6 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>