More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3401 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 379 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.96 
 
 		 373 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  49.07 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  50.42 
 
 		 373 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  50.69 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  50.69 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 		 373 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  50.14 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.98 
 
 		 373 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  51.73 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  48.07 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  47.87 
 
 		 378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5221  Extracellular ligand-binding receptor  45.76 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.029602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  47.34 
 
 		 375 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  47.08 
 
 		 460 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  46.86 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  46.07 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  44.92 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 		 376 aa  296  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  41.58 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  45.53 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  45.26 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  46.86 
 
 		 377 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  41.03 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.76 
 
 		 402 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  41.78 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  43.97 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.8 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  46.99 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  41.34 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  43.58 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.86 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  40.81 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  43.52 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  42.86 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  42.16 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  42.86 
 
 		 372 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  44.77 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  42.41 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  42.69 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  42.57 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  42.9 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  42.69 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  43.19 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.98 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.08 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.44 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  42.44 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.44 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  43.02 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  42.29 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.81 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.81 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.81 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.15 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  42.07 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.23 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 		 379 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  43.6 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  41.98 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  41.98 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.23 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  43.91 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  44.16 
 
 		 599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  43.02 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  43.63 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  40.72 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  42.86 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.39 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  42.16 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.19 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  42.02 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.44 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.92 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  40.44 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  41.03 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  40.29 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  41.91 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  41.74 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>