More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1045 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 378 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  73.06 
 
 		 377 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5221  Extracellular ligand-binding receptor  75.64 
 
 		 379 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.029602  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  56.32 
 
 		 373 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.22 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  54.45 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.03 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  54.45 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  53.26 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 		 373 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  53.68 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  48.36 
 
 		 375 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  48.44 
 
 		 376 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 		 376 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  48.43 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  44.24 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  46.7 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  45.5 
 
 		 380 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  45.88 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  44.5 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  43.38 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  44.88 
 
 		 375 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  46.61 
 
 		 376 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  46.29 
 
 		 401 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  43.11 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  44.19 
 
 		 401 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  43.02 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  45.32 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  45.82 
 
 		 375 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  43.9 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.84 
 
 		 402 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  43.56 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  43.29 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  43.55 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  43.86 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  44.35 
 
 		 380 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  43.3 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  45.66 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  41.95 
 
 		 376 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  43.38 
 
 		 336 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.61 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.9 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.9 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  42.9 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.61 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  42.9 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.61 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.61 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  42.61 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.61 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.61 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  42.9 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.59 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.9 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  40.59 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  42.9 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.19 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.52 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  43.48 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  42.47 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.59 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  43.73 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  40.35 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.78 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  42.39 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  42.39 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  42.39 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  42.12 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  42.12 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  40.59 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.17 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.17 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.17 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.17 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  43.17 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  42.06 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  41.52 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  42.9 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  43.13 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  44 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  42.05 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  41.52 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  40.9 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  42.32 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  42.32 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  39.42 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  41.45 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>