More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0360 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
381 aa  772    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  35.03 
 
 
376 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  38.07 
 
 
375 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  38.97 
 
 
376 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  35.64 
 
 
393 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  38.32 
 
 
373 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
383 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 
372 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
382 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.95 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  32.42 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
378 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
378 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
392 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
378 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
392 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.14 
 
 
371 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
392 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 
371 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 
371 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
375 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
378 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  29.28 
 
 
368 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
372 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
377 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 
375 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
368 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  34.54 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
368 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  30.03 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  30.03 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  30.03 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
417 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.03 
 
 
379 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  29.01 
 
 
368 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
388 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 
399 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 
370 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
370 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.82 
 
 
396 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  29.09 
 
 
380 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  30.79 
 
 
367 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
388 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
382 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
370 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
382 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.38 
 
 
382 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  30.52 
 
 
367 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 
367 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
388 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  30.52 
 
 
367 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 
373 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  30.52 
 
 
367 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  31.58 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.32 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 
370 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  30.25 
 
 
367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 
367 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  30.25 
 
 
367 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
388 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  30.25 
 
 
367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
371 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
377 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 
367 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 
379 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
402 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 
379 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 
379 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
369 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
374 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
368 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
400 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  30.05 
 
 
369 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  30.05 
 
 
369 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
379 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  29.63 
 
 
369 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
369 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  30.05 
 
 
369 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  30.05 
 
 
369 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
388 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
383 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.79 
 
 
374 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  32.14 
 
 
375 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.61 
 
 
388 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  29.79 
 
 
369 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>