More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5431 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
372 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  90.32 
 
 
375 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  72.58 
 
 
373 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  70.66 
 
 
377 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  66.49 
 
 
371 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  70.71 
 
 
388 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  62.77 
 
 
372 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  61.81 
 
 
373 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  62.89 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  59.07 
 
 
371 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.07 
 
 
371 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  61.96 
 
 
374 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  58.79 
 
 
371 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  57.91 
 
 
371 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  57.87 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  57.34 
 
 
372 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  57.91 
 
 
368 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  57.06 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  56.71 
 
 
368 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  53.3 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  53.02 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  53.95 
 
 
373 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  53.39 
 
 
371 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  53.09 
 
 
368 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  54.37 
 
 
366 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  53.93 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  49.59 
 
 
368 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  52.35 
 
 
378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  52.53 
 
 
378 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  52.53 
 
 
378 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  52.35 
 
 
378 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  52.97 
 
 
413 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  49.04 
 
 
368 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  51.56 
 
 
373 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  48.76 
 
 
368 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  50.82 
 
 
364 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  52.5 
 
 
377 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  52.97 
 
 
374 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  51.27 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  50.76 
 
 
364 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  49.14 
 
 
367 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  49.43 
 
 
374 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.4 
 
 
380 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  47.74 
 
 
366 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  50.98 
 
 
378 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  49.29 
 
 
371 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  50.15 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  48.51 
 
 
368 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  48.57 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0988  Extracellular ligand-binding receptor  44.29 
 
 
371 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0919893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1054  extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 
370 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1184  Extracellular ligand-binding receptor  41.85 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 
373 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  47.79 
 
 
370 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  45.28 
 
 
375 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  46 
 
 
374 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 
371 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.71 
 
 
374 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  45.59 
 
 
372 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.29 
 
 
399 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  44.16 
 
 
373 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  45.29 
 
 
372 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  44.86 
 
 
375 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  45.29 
 
 
372 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  45.29 
 
 
372 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  45 
 
 
372 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  44.71 
 
 
372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  45 
 
 
371 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  45 
 
 
371 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  45 
 
 
371 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  43.91 
 
 
375 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  44.35 
 
 
370 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  44.41 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  43.02 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 
371 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 
371 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  43.55 
 
 
358 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 
371 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  43.58 
 
 
362 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 
371 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  41.1 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  40.88 
 
 
371 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  40.88 
 
 
371 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  40.61 
 
 
371 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  41.83 
 
 
366 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  42.18 
 
 
373 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 
373 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  43.15 
 
 
373 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  43.15 
 
 
373 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  41.89 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  40.76 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  38.42 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  41.89 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.29 
 
 
367 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  41.29 
 
 
367 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.29 
 
 
367 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  41.29 
 
 
367 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.29 
 
 
367 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.29 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>