More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1118 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  95.96 
 
 
371 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
371 aa  760    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  70.89 
 
 
371 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  70.89 
 
 
371 aa  564  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  70.89 
 
 
371 aa  564  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  66.58 
 
 
373 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  65.41 
 
 
372 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  66.85 
 
 
374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  64.32 
 
 
371 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  55.68 
 
 
388 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  53.02 
 
 
372 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  53.53 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  54.19 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  50.42 
 
 
377 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  51.52 
 
 
368 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  50.54 
 
 
373 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
378 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
378 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  49.05 
 
 
371 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  49.47 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  49.73 
 
 
377 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  48.24 
 
 
371 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  49.03 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  48.59 
 
 
368 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  49.73 
 
 
374 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  48.19 
 
 
372 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  47.15 
 
 
373 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.66 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 
371 aa  342  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  49.58 
 
 
370 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  46.49 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  47.84 
 
 
378 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  46.51 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  45.45 
 
 
368 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  45.8 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  44.96 
 
 
372 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  45.03 
 
 
373 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  43.25 
 
 
368 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  46.13 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  43.4 
 
 
364 aa  311  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  44.97 
 
 
366 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  45.77 
 
 
368 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  45.22 
 
 
364 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  42.15 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  42.15 
 
 
368 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  43.79 
 
 
367 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  43.8 
 
 
370 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  41.85 
 
 
375 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  43.17 
 
 
373 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 
367 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  42.02 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.01 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  42.01 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  42.01 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  42.01 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  41.72 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  42.17 
 
 
358 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.18 
 
 
374 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  42.42 
 
 
375 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  40.66 
 
 
371 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  42.31 
 
 
371 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  41.72 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  41.72 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  41.72 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  42.01 
 
 
372 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  42.01 
 
 
372 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  42.31 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  41.84 
 
 
373 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  41.06 
 
 
374 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  40.52 
 
 
375 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  40.39 
 
 
371 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  39.66 
 
 
370 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  40.39 
 
 
371 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  41.52 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 
371 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 
362 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  40.35 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  38.72 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  40.35 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  38.76 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3766  extracellular ligand-binding receptor  40.68 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1184  Extracellular ligand-binding receptor  37.94 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  37.43 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  37.15 
 
 
371 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  39.23 
 
 
374 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.15 
 
 
371 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1054  extracellular ligand-binding receptor  37.23 
 
 
370 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  38.94 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  38.55 
 
 
366 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  37.71 
 
 
369 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  37.43 
 
 
369 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  37.43 
 
 
369 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  37.43 
 
 
369 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  37.43 
 
 
369 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0988  Extracellular ligand-binding receptor  39.02 
 
 
371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0919893  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2462  Extracellular ligand-binding receptor  39.35 
 
 
373 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.109923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  37.99 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>