More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2462 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  94.12 
 
 
374 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  94.65 
 
 
374 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2462  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
373 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.109923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3766  extracellular ligand-binding receptor  78.2 
 
 
378 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  66.94 
 
 
375 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  68.07 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  55.12 
 
 
364 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  55.24 
 
 
366 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  44.32 
 
 
368 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  41.41 
 
 
371 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
372 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  40.88 
 
 
388 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  41.34 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  41.76 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  42.23 
 
 
370 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  38.31 
 
 
371 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.31 
 
 
371 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  41.88 
 
 
372 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  41.93 
 
 
375 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  39.44 
 
 
373 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  40.11 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  40.66 
 
 
370 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  39.18 
 
 
368 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 
371 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
417 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 
371 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  39.06 
 
 
371 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
374 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
370 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  39.53 
 
 
377 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  38.44 
 
 
371 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 
373 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  39.38 
 
 
371 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  38.25 
 
 
372 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  39.15 
 
 
368 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  38.5 
 
 
413 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  37.05 
 
 
364 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  39.3 
 
 
371 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  38.78 
 
 
374 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  38.61 
 
 
378 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  36.76 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  38.06 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  38.7 
 
 
378 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  39.72 
 
 
373 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  38.7 
 
 
378 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3879  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  38.67 
 
 
367 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3836  leucine-specific-binding protein  38.67 
 
 
365 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  38.4 
 
 
367 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  37.33 
 
 
371 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  37.57 
 
 
366 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3769  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  38.67 
 
 
365 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  38.4 
 
 
367 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 
373 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  38.79 
 
 
374 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
370 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
374 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  34.92 
 
 
368 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 
371 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  37.88 
 
 
377 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  37.47 
 
 
367 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  35.69 
 
 
370 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
367 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  37.47 
 
 
367 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  37.47 
 
 
367 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  36.31 
 
 
368 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  37.19 
 
 
367 aa  222  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 
373 aa  222  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 
373 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  35.76 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  37.19 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  37.19 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  35.89 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  37.19 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  36.05 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  37.19 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
371 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  35.44 
 
 
371 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
371 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  36.09 
 
 
370 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 
371 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  34.97 
 
 
375 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.52 
 
 
374 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  37.03 
 
 
370 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  35.29 
 
 
373 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
371 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.36 
 
 
380 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.26 
 
 
371 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  34.36 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
375 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  34.45 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  34.42 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.47 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  36.44 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  35.47 
 
 
369 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  34.17 
 
 
371 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.47 
 
 
369 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>