More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0326 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  91.92 
 
 
375 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
362 aa  730    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2757  Extracellular ligand-binding receptor  67.05 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2534  extracellular ligand-binding receptor  67.05 
 
 
374 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2462  Extracellular ligand-binding receptor  68.42 
 
 
373 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.109923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3766  extracellular ligand-binding receptor  66.48 
 
 
378 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  60.9 
 
 
364 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  58.77 
 
 
366 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  44.77 
 
 
368 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  43.41 
 
 
372 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.28 
 
 
371 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.28 
 
 
371 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  41.38 
 
 
371 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  43.82 
 
 
388 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  43.34 
 
 
370 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 
375 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  39.44 
 
 
372 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  43.77 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  43.24 
 
 
417 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  42.27 
 
 
372 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 
371 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  41.07 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  42.49 
 
 
373 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  39.66 
 
 
372 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  39.66 
 
 
373 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  41.79 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  39.6 
 
 
370 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  40.18 
 
 
371 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40.56 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  40.68 
 
 
413 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  39.14 
 
 
371 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  39.64 
 
 
373 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  40.96 
 
 
374 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  40.23 
 
 
374 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  37.64 
 
 
364 aa  261  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  40.23 
 
 
370 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  39.55 
 
 
371 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  39.72 
 
 
371 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 
371 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  41.23 
 
 
378 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  40.95 
 
 
378 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  39.27 
 
 
372 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  41.08 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  41.08 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  40.5 
 
 
377 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  38.89 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  38.22 
 
 
373 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  36.44 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.72 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  36.77 
 
 
373 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  37.78 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  38.51 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  38.51 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  36.28 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.28 
 
 
399 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  36.28 
 
 
372 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  36.28 
 
 
372 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  36.28 
 
 
372 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  35.65 
 
 
371 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  35.65 
 
 
371 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  36.55 
 
 
373 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  35.65 
 
 
371 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  39.38 
 
 
378 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  35.65 
 
 
371 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  36.26 
 
 
373 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 
375 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  36.42 
 
 
369 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 
370 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  34.47 
 
 
368 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  36.47 
 
 
368 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 
371 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  36.58 
 
 
373 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  34.37 
 
 
368 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
372 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  34.66 
 
 
368 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
372 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 
374 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  34.9 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  37.25 
 
 
374 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 
371 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
371 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  34.55 
 
 
370 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  35.48 
 
 
373 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.73 
 
 
369 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  34.83 
 
 
370 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.73 
 
 
369 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.73 
 
 
369 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.73 
 
 
369 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.73 
 
 
369 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.31 
 
 
374 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  35.41 
 
 
367 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.55 
 
 
369 aa  222  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  35.55 
 
 
369 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>