More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3099 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
367 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  96.19 
 
 
367 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  72.01 
 
 
368 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  72.01 
 
 
368 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  71.74 
 
 
368 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  71.74 
 
 
368 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  74.49 
 
 
368 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  47.73 
 
 
372 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  48.57 
 
 
372 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
373 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  45.45 
 
 
371 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  45.56 
 
 
388 aa  316  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  44.85 
 
 
372 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.89 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.89 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  43.21 
 
 
368 aa  301  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  44.04 
 
 
368 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  44.71 
 
 
377 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  44.01 
 
 
371 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  44.04 
 
 
370 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  46.31 
 
 
373 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  43.49 
 
 
371 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  43.65 
 
 
366 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.79 
 
 
371 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  44.71 
 
 
364 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 
370 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  43.79 
 
 
371 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 
371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  43.58 
 
 
373 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  43.85 
 
 
373 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 
373 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3769  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.99 
 
 
365 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.71 
 
 
367 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  41.99 
 
 
367 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3879  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.71 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3836  leucine-specific-binding protein  41.71 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  43.61 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  42.11 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  41.27 
 
 
372 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  42.66 
 
 
375 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
366 aa  272  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  42.06 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  42.06 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  42.06 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.78 
 
 
367 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  40.81 
 
 
373 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.78 
 
 
367 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.78 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  41.78 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  41.78 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  41.78 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  42.9 
 
 
371 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.9 
 
 
371 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  42.9 
 
 
371 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  40.24 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  42.9 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
371 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  41.92 
 
 
371 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  39.61 
 
 
371 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.94 
 
 
399 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  42.34 
 
 
375 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  42.94 
 
 
372 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  42.94 
 
 
372 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  42.94 
 
 
372 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  39.61 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  41.48 
 
 
374 aa  262  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.33 
 
 
371 aa  262  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  42.65 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  42.65 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  38.89 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 
374 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  41.59 
 
 
370 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  42.35 
 
 
372 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  39.83 
 
 
369 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03307  leucine transporter subunit  39.55 
 
 
369 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 
371 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  39.83 
 
 
369 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03260  hypothetical protein  39.55 
 
 
369 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.11 
 
 
374 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  40.06 
 
 
371 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  42.11 
 
 
373 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3872  Extracellular ligand-binding receptor  40.17 
 
 
370 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  39.72 
 
 
371 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  40.83 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  39.28 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  40.41 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  39.44 
 
 
370 aa  252  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  39.61 
 
 
371 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  39.61 
 
 
371 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  40.83 
 
 
378 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>