More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0834 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
373 aa  759    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  61.73 
 
 
376 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  58.6 
 
 
376 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  58.29 
 
 
393 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  58.47 
 
 
375 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  57.51 
 
 
373 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  38.5 
 
 
381 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  36.49 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  36.49 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  36.49 
 
 
371 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  36.49 
 
 
371 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 
372 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
372 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
372 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.58 
 
 
399 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
372 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
372 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
375 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 
372 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 
372 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  34.12 
 
 
377 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  34.14 
 
 
389 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  36.07 
 
 
368 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
378 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  34.45 
 
 
372 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
373 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  35.08 
 
 
376 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.16 
 
 
371 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 
400 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
372 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  32.8 
 
 
372 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  32.42 
 
 
375 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
388 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
367 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
417 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  32.68 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  32.25 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.71 
 
 
373 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
409 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  36.27 
 
 
377 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
375 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
372 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 
368 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  31.1 
 
 
372 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  33.25 
 
 
392 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  32.27 
 
 
371 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  33.16 
 
 
413 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
370 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
371 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
367 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  32.8 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 
374 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  35.83 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
370 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  29.35 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
371 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
371 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.96 
 
 
380 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
374 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
373 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  28.88 
 
 
368 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
373 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.53 
 
 
374 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  35.03 
 
 
376 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
368 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
397 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
460 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  32.35 
 
 
377 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
370 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
381 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
371 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 
382 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
368 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 
381 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.13 
 
 
371 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.13 
 
 
371 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.49 
 
 
402 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  31.83 
 
 
364 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 
381 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 
371 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.17 
 
 
380 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  31.88 
 
 
380 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>