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for query gene Sros_6002 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  100 
 
 
389 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  77.37 
 
 
409 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  31.59 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 
376 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  34.97 
 
 
375 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 
373 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  34.92 
 
 
372 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  34.97 
 
 
368 aa  176  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
417 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  35.21 
 
 
375 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
388 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
375 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
374 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.71 
 
 
374 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
372 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  34.55 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  35.95 
 
 
370 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  35.48 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
373 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  35.55 
 
 
372 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
372 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  35.01 
 
 
373 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
371 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
372 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  34.02 
 
 
373 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.22 
 
 
399 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  33.54 
 
 
375 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
372 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 
371 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  34.88 
 
 
371 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  34.88 
 
 
371 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
372 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  34.88 
 
 
371 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
372 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
372 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 
371 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  33 
 
 
368 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  35.22 
 
 
371 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  33.72 
 
 
373 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
358 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.88 
 
 
371 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
371 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
373 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
366 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
371 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
377 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  34.33 
 
 
368 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
376 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 
372 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
373 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03307  leucine transporter subunit  33.14 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
370 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  33.43 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03260  hypothetical protein  33.14 
 
 
369 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
367 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
400 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  33.14 
 
 
369 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  33.55 
 
 
393 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  31.7 
 
 
370 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  33.83 
 
 
370 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  31.78 
 
 
368 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
376 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 
373 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 
371 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 
384 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 
384 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  36.43 
 
 
367 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  31.1 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.73 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 
381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.64 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  33.23 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  31.9 
 
 
371 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
381 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  31.59 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  31.59 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  31.59 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  31.59 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
372 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
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NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 
366 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
384 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
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NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
384 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
384 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
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NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  31.73 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 
398 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  31.6 
 
 
371 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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