More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3089 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  77.44 
 
 
390 aa  618  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  73.37 
 
 
395 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  70.22 
 
 
390 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  69.11 
 
 
389 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  66.23 
 
 
395 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  66.16 
 
 
393 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  64.95 
 
 
397 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  67.89 
 
 
406 aa  521  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  66.58 
 
 
392 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  68.14 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  68.78 
 
 
394 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  60.05 
 
 
390 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  63.49 
 
 
387 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  58.06 
 
 
402 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  56.3 
 
 
395 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  57.5 
 
 
402 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  58.17 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  55.12 
 
 
395 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  53.17 
 
 
392 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  52.22 
 
 
392 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 
412 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  35.91 
 
 
410 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  34.2 
 
 
390 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  34.41 
 
 
395 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  34.5 
 
 
399 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  37.04 
 
 
392 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  32.85 
 
 
401 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 
388 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
389 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
392 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  35.69 
 
 
392 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  35.38 
 
 
392 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 
389 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  33.79 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 
391 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  34.06 
 
 
398 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  34.06 
 
 
390 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
391 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
391 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 
400 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  33 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  32.44 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
397 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
390 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 
395 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  35.71 
 
 
393 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  35.41 
 
 
388 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  35.41 
 
 
388 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  34.09 
 
 
392 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 
395 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
386 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
391 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
384 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 
392 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  31.97 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 
395 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 
391 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
390 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
390 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
390 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
413 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  31.69 
 
 
390 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
399 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
426 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
390 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  31.79 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 
407 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 
390 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 
398 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  26.58 
 
 
393 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
376 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  30.21 
 
 
381 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.67 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.92 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  27.95 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
398 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
392 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  28.65 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>