More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4181 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 412 aa  837    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 410 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  36.01 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  35.75 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  34.69 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  33.66 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  34.42 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  32.52 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  32.58 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.16 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.69 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 		 390 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.98 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.71 
 
 		 390 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  29.89 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 399 aa  163  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  27.92 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.49 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 390 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.06 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.63 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  32.42 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 399 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 		 389 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  26.74 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 407 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  25.57 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>