More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3998 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
389 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  66.67 
 
 
398 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  65.57 
 
 
396 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  59.28 
 
 
390 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  60.77 
 
 
387 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
399 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 
388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  44.85 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  45.5 
 
 
388 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  46.91 
 
 
390 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  45.76 
 
 
390 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  47.95 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  46.3 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  44.74 
 
 
389 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  42.2 
 
 
389 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  45.63 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  46.81 
 
 
386 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  43.68 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  43.78 
 
 
395 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  44.97 
 
 
381 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  44.86 
 
 
391 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  44.35 
 
 
376 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  43.13 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  43.09 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  43.68 
 
 
390 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 
389 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  44.6 
 
 
399 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  36.15 
 
 
393 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 
387 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 
389 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  36.46 
 
 
402 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  37.61 
 
 
402 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 
395 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  36.55 
 
 
390 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 
395 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  37.28 
 
 
394 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
392 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 
395 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 
395 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  35.38 
 
 
387 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
397 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 
390 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
392 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  34.55 
 
 
410 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 
395 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 
390 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  33.33 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 
392 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
413 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  33.04 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
400 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
414 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  32.16 
 
 
392 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
412 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  28.61 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.45 
 
 
399 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 
423 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
391 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
395 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
384 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
390 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 
390 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
391 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
390 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 
390 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
397 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
390 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
388 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
388 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
398 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.76 
 
 
393 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
415 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.57 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
396 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
395 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.31 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
392 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.88 
 
 
385 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.82 
 
 
392 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  28.16 
 
 
405 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
396 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  23.67 
 
 
405 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  26.58 
 
 
406 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  23.67 
 
 
405 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>