More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1987 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 389 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  56.6 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  57.95 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  54.08 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  54.12 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  54.1 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  50.13 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  44.59 
 
 		 389 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  44.56 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  44.93 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  46.74 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  46.58 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  43.99 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  46.45 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  44.24 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  45.63 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  43.59 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  40.85 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  41.8 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  40.79 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  40.9 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  35.14 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  39.67 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  40.16 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.07 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.29 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.39 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 382 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  24.5 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  23.8 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1110  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.37 
 
 		 134 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  26.51 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.93 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  24.65 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  21.96 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 461 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>