More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3688 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 		 399 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  51 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  42.49 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  38.82 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  39.66 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  38.1 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  36.02 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  32.52 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  27.72 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  28.57 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  28.32 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.65 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  27.6 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 376 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  26.11 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  26.32 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.2 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  26.03 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  26.63 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  25.51 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  25.25 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 		 395 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  23.16 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  25.35 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.93 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  27.95 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  22.56 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.6 
 
 		 1118 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>