More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3317 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 401 aa  809    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  47.27 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  46.05 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  43.69 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 		 423 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  44.33 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.82 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  36.54 
 
 		 413 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  35.94 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.3 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.83 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  27.03 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  27.6 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  28.02 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.89 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.69 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  28.2 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  26.54 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.56 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  26.52 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.47 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  26.89 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.82 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  28.61 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>